这里有句话，
Trying to specify a boundary face 4(29 20 0 9) on the face on cell 2 which is either an internal face or already belongs to some other patch. This is face 0 of patch 3 named cylinder.
这个意思是说，在第三个边界 (patch)，边界名是 cylinder，在这个边界上的第 0 个面 (face)。这个面要么是一个内部的面，要么已经是其他边界的面了。
所以，你把这个 cylinder 边界上的这个面 (组成这个面的顶点是 29 20 0 9) 删除或是用 // 把它屏蔽掉，就可以了。